高雄為台灣的工業重鎮，鋼鐵工廠生產鋼筋鋼管等產品，工廠家數全國佔有率達25%，另化工、水泥、油品、板材及度量衡器國內製造和進口產品眾多，皆由本分局負責檢驗。而高屏及澎湖地區因先天的雙港優勢和優越的海灣條件，成為遠洋捕撈及養殖業的農漁產品集散地，產品經本分局檢驗合格並核發水產品衛生證明，得以輸銷國外，年產值達32.5億元。
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